1、心血管系统并发症  发生率可达并发症总数40％左右，最为常见。大多属于非特异性损害如窦性心动过速、窦性心动过缓、ST-T异常及心肌酶学异常现象，少数可能出现早博、房室传导阻滞、完全性或不完全性右束支传导阻滞等心电图异常改变。 这是最容易被忽略的一个症状，因为很多医生对这些症状不熟悉，甚至不知道，包括脾气变大、易激惹、爱哭、走路不稳等，在我以前的心肌损伤里有详细地描述。
　2.消化系统并发症 发生率约占并发症总数的30%左右，仅次于心血管并发症。多数表现为胃肠道损害，有恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，极少数出现肝损害表现如转氨酶升高，肝脏轻度肿大。针对消化系统并发症的处理，主要是控制支原体感染，并根据患儿实际表现予以必要的对症处理或护肝治疗。
　　3.肾脏并发症 发生率约占并发症总数的20％左右。一般表现为一过性肾损害，出现血尿、蛋白尿、水肿及血压增高等临床表现，但肾功能正常。这种一过性肾功能损害预后良好，可随着病情改善而好转，极少转为慢性肾损害。但不少病人会有持续性镜下血尿。
　　4.血液系统并发症 发生率约为并发症总数的10％左右。主要表现为血小板计数减少，较严重者可有出血倾向，个别患儿可能出现溶血性贫血或粒细胞减少。针对血液系统并发症的治疗，在控制支原体感染的基础上给予强的松、丙种球蛋白治疗，疗效良好，患儿可获痊愈。
　　5.其他系统并发症 偶尔还可见到神经系统或皮肤黏膜损害，多数为一过性损害，随着原发病的有效控制，以及适量应用激素而痊愈，不会遗留后遗症。