北京大学第三医院(简称北医三院)始建于1958年，是卫生部部管集医疗、教学、科研和预防保健为一体的现代化综合性三级甲等医院，是2008年北京奥运会定点医院。
    在几代人的努力下，医院已拥有许多国内外著名的特色学科。生殖医学中心是国内最早，也是目前亚洲最大的生殖医学中心之一；脊柱外科在国内外居于领先地位；运动医学研究所在运动创伤及康复、运动营养、关节镜治疗等领域一直处于国际同步、国内领先水平，是全国唯一的中国奥委会指定运动员伤病防治中心；心内科综合实力在国内处于先进水平，血管医学研究所是教育部重点实验室和卫生部重点实验室的组成部分，也是北京大学心血管重点建设学科的牵头单位；眼科中心在青光眼、白内障、眼外伤以及眼科疑难重症的诊治方面居于国内领先水平。
    医院医疗有许多重大突破。1988年中国大陆首例试管婴儿在我院诞生，标志着我国生殖医学跨入世界先进行列。骨科在颈椎病、脊柱肿瘤、畸形等的诊治处于国内领先水平；2001年成立移植中心，目前肝肾移植手术技术已跃居国内先进水平；2002年骨科《颈椎病诊断与治疗研究》获国家科技进步二等奖；妇产科《人类卵泡及其细胞的体外发育》获教育部提名国家科学技术奖－自然科学二等奖。2004年，成为北京地区首家获准开展人类辅助生殖技术的医院，国内首家“国家纳米科学中心生物医学协作实验室”落户我院。2005年运动医学研究所获得第28届奥运会科技工作特别贡献奖、第28届奥运会科技攻关与科技服务奖。2006年，国内首例冻精、冻卵、冻胚“三冻”试管婴儿在我院诞生。
    近年来，医疗业务稳步增长。门急诊总量连续10余年居北京市各大医院前列。2007年，日均门急诊量8000余人次，门急诊总量突破200万大关，达211万余人次；年出院患者4万余人次，创历史新高。平均住院日进一步缩短，突破10日大关，为9.73天，创历史新低。
    在完成繁重医疗任务的同时，医院还承担着大量的教学任务。承担北京大学临床医学、药学、护理、检验、预防专业的教学任务，以及研究生、进修医师等培养工作。14个科室和10个科室分别承担着北京市专科医师、亚专科医师的培训任务。2005年，医院《临床医学专业学位的培养改革与实践》获国家级教学成果二等奖。2007年，医院以全“A”的成绩通过教育部本科教学工作水平评估检查。
    近年来，医院科研工作取得了长足进步。在2004-2006年SCI收录论文排名中，我院连续3年排在医疗机构前20位；2006年，妇产科、运动医学、消化科分别获得国家“十一五”科技支撑计划牵头项目。2007年，骨科入选教育部创新团队项目。
几十年来，医院秉承“病人至上”的宗旨，“团结、奉献、求实、创新”的院训，“病人信任、员工爱戴、同行尊重、社会认可”的办院理念，努力为人民群众提供优质、高效、安全、便捷的医疗服务。